14 年前
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女检察官周楠发现自己分别10年的恋人成为一起医疗事故的被告，而自己正是这起案子的检控官，与此同时，周楠的父亲周岳川所经营的营养液出现了问题，周岳川的女婿程可明企图把这一发现公开，但周岳川和助手、学生曲东惟一能做的就是掩盖真相……。表面上看来，东云名乃（古谷静佳配音）是一个外表可爱又有点天然呆的黑发女孩，可是，她背后醒目的发条暴露了她的真实身份——由博士（今野宏美配音）所改造的少女机器人。虽然对于自己背后的发条感到十分自卑，但博士总是以其非常可爱为由拒绝帮助名乃进行改造。 在名乃就读的1年纪Q班中，汇聚着名乃的诸多好友们——个性过于活泼以至于经常暴走的相生祐子（本多真梨子配音），常常陷于对同性恋情的幻想之中的美术型女生长野原美绪（相泽舞配音），以及外表沉默安静内里腹黑毒舌的三好学生水上麻衣（富樫美铃配音）。就这样，经常处于脱线状态的日常和激烈的吐槽在这三人之间展开了。。21世纪末，人类的科技水平已高度发达，克隆人技术和宇宙航行早已实现，不再是梦想。与此同时，许多科学家仍孜孜不倦追索着人类起源的秘密与真相。通过对许多古老文明的考察与对比，科学家伊丽莎白·肖和查理·赫洛维发现，人类可能是来自一个遥远星系的外星人创造的。在Weyland公司资助下，他们乘坐维克丝所掌管的宇宙飞船普罗米修斯号前往那颗未知的星球。
经过对当地的考察，地球人的设想成功得到印证。可是他们贸然探查“神的秘密”的行为，也将自己引入万劫不复的深渊……。
