9 年前
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神南大学工学部建筑系副教授犀川创平（绫野刚 饰）及该专业三年级学生西之园萌绘（武井咲 饰）近期正在撰写关于“最接近神的人类”——天才少女真贺田四季（早见明里 饰）的报告。在此期间，二人经土木工程系副教授喜多北斗（小泽征悦 饰）的介绍前往极地环境研究中心参观，谁知却目击了经过缜密计划的密室杀人事件。萌绘无视犀川教授的漠然，极其热情地展开推理和调查，更将自己置身于莫大的危险之中。最终在犀川教授的介入下，真相浮出水面。以此为契机，师生二人又接连卷入各种各样的密室杀人案中，他们将凭借现场的蛛丝马迹找出真正的凶手……
本片根据森博嗣的小说改编。。在阻止了1963年的世界末日之后，伞学院回到了现在，确信他们阻止了最初的世界末日，并彻底修复了这条遗忘的时间线。然而在短暂的庆祝之后，他们意识到自己（彻底）失算了。聪明、时尚而冰冷的麻雀学院和伞学院在一场激烈的对峙中发生冲突，然而这远非伞学院最大的麻烦。伞学院将直面挑战、损失和惊喜，并着手处理一个在宇宙中大搞破坏的不明实体（而这可能是他们自己一手造成的）。现在他们需要做的就是说服爸爸的新（也可能更优秀的）家庭，来帮助纠正因他们的到来所导致的错误。他们能否找到回到世界末日前的方法？或者这个新世界不只是时间线上的一个小错误，大难即将临头？。
