24 年前
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2000年，一个科学探险队在南极洲针对被称作“第一使徒”亚当的“光之巨人”进行探险。在对其进行接触实验时，“光之巨人”自毁，从而发生了“第二次冲击”，进而导致世界大战。最后，人类人口减半，地轴偏转、气候改变。根据对“第二次冲击”的调查，联合国在日本箱根成立人工进化研究所（即GEHIRN）从事EVA（指机器人）的发展研究，后GEHIRN利用在人工进化研究所下方发现的巨大空洞建造了总部。
另一方面，联合国下属秘密组织SEELE为了使人类进化，开始实行人类补完计划，就是将所有人的灵魂汇集在一起，通过中和每个人的AT力场，使每个人回归LCL之海。
2004年，EVA初号机进行启动试验时发生事故，碇真嗣的母亲碇唯消失，碇源堂开始执行“碇源堂版本的人类补完计划”。2010年，GEHIRN被改建成NERV。
2015年开始，根据SEELE人类补完计划剧本的安排，一种不明巨型生物“使徒” 开始在日本登陆，并向NERV总部进攻，NERV组织EVA消灭使徒。在NERV与使徒作战的同时，碇源堂秘密地执行它自己的计划。随着时间推移，碇源堂 的计划逐渐被SEELE发现，NERV与SEELE产生了矛盾并不断恶化。这一矛盾在电视版中没有得到解决。在剧场版中，NERV于SEELE的矛盾激 化，SEELE派出军队进攻NERV，在占领了NERV后发动了第三次冲击。全人类全部化为LCL之海，只有碇真嗣和明日香留了下来。。朱媛媛是一名胖主妇任劳任怨，没想渣男老公早就嫌弃她跟闺蜜搞在一起，她发现后被打晕，死里逃生后被亲生父亲找到，华丽变身复仇女神秦醒，却厌憎曾经那个愚蠢的自己，直到遇到一直苦寻她的叶庭深，爱让她放下仇恨。美国失业率飙升，城市沦为犯罪汪洋，政府启动最高法，建高墙围起一占地355万平方米的韦兰德区域安置罪犯。墙内的飙车党以弗兰肯斯坦为首，则玩起了死亡车赛，并通过网络直播成为平民世界的精神领袖。这引起了政府的不满，警察部门意图消灭弗兰肯斯坦的势力和威望，却告失败。新一批罪犯唐纳·吉布森、吉普希·萝丝等人被狱警用直升机投放到韦兰德监狱，他们也参与到死亡飞车比赛中。。
