19 年前
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拥有一头青色头发的男主角名字将叫作深井 青(フカイ·アオ，这名字在日语中带有“深青”的意义），是一名13岁少年。青的父亲兰顿·萨斯顿(Renton Thurston、レントン·サーストン)行踪不明，而母亲优莱卡(Eureka、エウレカ)也在10年前被美军带走了。由于继承了母亲的特殊基因，使得他能够看见人眼所不能看到的东西，如粒径为20nm大小的光粒子，红外线、紫外线等等（但在外太空这一特殊生理受到限制）。小时与诊疗所里的老医生深井 敏夫一同生活，现正在Generation Blue（蓝色世代）中。
女主角的名字将是阿拉塔·娜露，同样是13岁，是与青一同成长的青梅竹马。娜露因为童年时的事故而使拥有”ユタ”的力量(犹达，是日本冲绳以占卜为职业的灵媒师的名称)的眼睛醒觉。娜露有能够听懂珊瑚岩心声的特异功能，这是因为珊瑚岩的一部分在她体内成长，从某种程度上来说她和珊瑚岩存在部分融合，但正是因为这样，导致她自小身体虚弱，需要把氧气放入在手上的吸氧器，现与父亲、妹妹及祖母一同生活中。
本作的舞台也设定在冲绳的磐户岛上，当时的磐户岛正进行著自治权回复运动，但在某一天，在岛上出现的珊瑚岩受到了宿敌白细胞G-Monster的攻击，而为了保护磐户岛，男主角青与人型IFO（Intelligent Flying Object）相遇，并与G-Monster战斗的故事就此展开。。在得到线报前往逮捕一起谋杀案的重大嫌疑人的路上，总督察注意到异常状况，临时决定带队改道去处理一桩正在发生的持械抢劫案件，从而延误了逮捕嫌疑人的最佳时机。这到底是一个纯粹的巧合还是早有预谋的设计呢？在了解相关情况后，反腐小组AC-12决定介入调查……。谢尔盖（丹尼拉·科兹洛夫斯基 Danil Kozlovsky 饰）曾经是大学历史系的高材生，如今却成为了一个倒卖文物的小混混，他带领着齐烈普（Vladimir Yaglych 饰）、斯皮尔特（Andrey Terentyev 饰）和秋哈（Dmitry Volkostrelov 饰），整日穿梭在大大小小的古墓之中，企图找到能让他们一夜暴富的珍宝。
某日，在一间古墓中，四人意外发现了一个保险箱，保险箱内锁着的，竟然是写有四人名字的士兵证。吓坏了的谢尔盖一行人通过墓地旁边的湖泊穿越到了1942年，彼时，他们成为了苏军部队的战士，即将踏上战场。除了要面对敌人纷飞的炮火和无处不在的死亡威胁，谢尔盖一行人所面临的最大问题，就是如何回到现代。。
