18 年前
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正在调查坠落在太平洋上的不明飞行物体的海上自卫队二尉有动贵文（大澄贤也），遇到了突然出现的蓝光，受发光体的影响，导致遗传因子标准的变质，变成了凶恶的怪兽THE ONE。之后，他（THE ONE）从防卫厅内的特殊机关BCST（对生物工程学的研究机关）的监视下逃走，从此就没了音训。 另一方面，航空自卫队F15J飞行员真木舜一（别所哲也），为了多点时间陪伴患有先天性疾病的儿子继梦决定辞去官职。在最后一次飞行中真木与“红色发光体”在空中相遇。这是the one事件后3个月发生的事情。但是真木奇迹般地生还，然后转职成为了民航机飞行员，展开了新生活。对这样的真木还是有机关非常关注，尤其是BCST中的化学担当官水原沙罗，BCST将真木强制带走，在废工厂中搭建的BCST研究室进行身体上的监视。此时行踪不明的怪兽THE ONE像被某种东西吸引而回来了。遭受THE ON...。人山人海的东京车站，角落里轻轻拔枪，面带笑容的杀手淬然倒在屋顶的十字架旁。 “格路德”，日本头号杀手组织，排名第三的皆月美有树人称“野良猫”，以身穿黑色和服，腰带饰有金边黑猫而得名。皆月生性孤僻，惟独对技击和枪术抱有恋人般的热情。她杀人，也被人杀。在接受上京小夜子的任务分配时，她意外的被组织内的人马追击，看见躲在更深的黑暗里朝她扑来的危机。 一号杀手，年老的花田五郎在京都指点皆月：组织风雨飘摇，各路潜伏的力量都在争夺控制权。要杀皆月而后快的正是二号影子“百眼”。此人精于袭击和易容，据说从未有人见过他的真面目。倔强而孤独的皆月闻言转身而去，回返途中收留了孤女韩英惠，一个和她亦友亦徒的女孩。不久英惠为人所伤，这次下手杀人的却是上京小夜子。 组织内的杀手继续原因不明的被杀死去，每人都面带诡异的临终一笑。面对危局，皆月毅然出战，向“百眼”下了战书，约定了高手...。