23 年前
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故事发生在东京八丈岛近海，一座将全球各地警方监控相连接的高科技设施——“太平洋浮标”即将启动。为了与欧洲刑警组织管辖的范围联网，来自世界各地的工程师聚集在这里。基于人脸识别的全新“黑科技”也正在测试中……
与此同时，柯南一行人前往八丈岛观鲸，途中柯南接到冲矢昴（赤井秀一）的电话，被告知欧洲刑警组织成员在德国遭到琴酒的杀害。为调查真相的柯南潜入“太平洋浮标”。正当工程师们正在为系统启动而展开准备工作时，一桩案件突然发生！一名女工程师被黑暗组织绑架，她手中存有核心技术的U盘也落入了黑暗组织手中！
此时，水下传来未知潜水艇逼近的声音，令人毛骨悚然，一个神秘的黑影也正在悄悄接近灰原哀……。城中富豪稚子方俊朗(谭真一 饰)被绑架，CID探员赵展龙(黄宗泽饰)凭著一丝线索和无穷的精力，追踪绑匪戴少男(邓健泓 饰)至酒店。追查期间，碰上女记者唐晶(郑欣宜 饰)，因冒失莽撞，不是弄得展龙焦头烂额。案情未有突破，却又因一名酒店外籍住客确诊患有“新型流感”，牵连全幢酒店被当局下令即时封锁隔离，展龙亦被迫困在酒店内。原定酒店将会举行珠宝拍卖展，盗贼情侣拍档易早安(马浚伟 饰)、汪贾瑜(郭羡妮 饰)分别以泰国华侨富商及上海阔太假身份进驻酒店，觊觎马拉珠宝商人徐福生(于洋 饰)、钱家燕(林漪其 饰)夫妇手上的钻石。可是却遇上酒店被隔离，事出突然，令盗宝行动功亏一篑，二人亦被困酒店内。隔离期间，展龙被编配跟早安同房，为了方便查案，展龙只有掩饰身份，对早安自称是健身教练。于是一个兵，一个贼，被迫住在同一房间内……。
