8 年前
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一次偶然中，名叫芦屋瑞稀（前田敦子 饰）的女生遭遇了歹徒袭击，索性得到了佐野泉（中村苍 饰）相救，才得以保全，而本是跳高运动员的泉却因此而伤到了韧带，从此放弃了这项挚爱的运动。得知此消息，瑞稀的心中感到十分愧疚，于是，她乔装打扮成男生的样子，转入了泉所在的日本樱咲私立男子高校，成为了泉的同班同学兼舍友，希望能够借此机会鼓励泉重拾跳高。
在新的班级中，瑞稀结识了一帮有趣的同学们——个性开朗咋咋呼呼的中津秀一（三浦翔平 饰）、极具王子气质的难波南（桐山涟 饰）、拥有灵异体质的萱岛大树（柳下大 饰）和暗恋着难波南的中央千里（西井幸人 饰）等人。瑞稀能否保守自己身为女孩的秘密呢？她和泉之间日渐暧昧的关系又会向何处发展呢？。《科搜研之女》这个推理系列剧在日本众多的推理剧中有其独特的风格和存在感，那就是极强的专业性，这个作品就是站在科学搜查研究所的角度，通过科学的力量为破案创造条件，这个系列已经延续11年，每次电视剧拍摄，日本科学搜查研究所都会全力支持配合，剧中一些主要演员出演科学研究员的角色已经数年甚至十几年，对于科搜研这个单位的各类仪器和一般性工作都非常熟悉，有评论说这个系列的一些主要演员已经具备了通过科学调查侦破现实中一般性案件的能力，从中也可以看出本剧极强的专业性，有人说本剧是日本版的【csi】，但实际上两者还是有一定区别的，【科搜研】更强调科学研究，所有事件都是从科学调查研究角度来分析，而【csi】相对更多元化一些，是案件现场各类搜查的集合体。。公元前222年，秦发兵六十万攻楚，楚军节节败退。乱军之中，日后的名将之星蒙恬（蒙武之子）与未来的西楚霸王少羽第一次在沙场相遇。楚军寡不敌众，情况危急万分，少年霸王与帝国将星的初次交锋，胜负难测……两年之后，秦灭六国，统一中国，成为历史上第一位帝王。然而，乱世并未结束，一股强大的力量正在为颠覆大秦而崛起。他们分别是墨家、儒家、道家、法家、兵家、纵横家、阴阳家、医家、农家，历史上称之为诸子百家。如今，天下反秦势力最后的堡垒——墨家机关城，正遭遇三百年来最大的一次危机。盗跖虽然成功脱出，赶往求援，却被一神秘少女拦住去路。与此同时，墨家巨子率领各家英雄在赶往机关城途中，也遭到了阴阳家高手出其不意的暗袭。机关城中，身中剑伤的盖聂挥剑斩向身后……十二年后，纵与横再次交锋，鬼谷的宿命之战，终将在此有一个了结！墨家机关城会否就此陷落？墨家巨子临时传授天明非攻秘技，天明逆转获胜，卫庄负伤离开。墨家巨子临终传位天明，并启动青龙，机关城化为废墟。众人从地下水路撤离，突破秦军围追堵截，前往桑海，却发现城内布满项氏及墨家众人的悬赏令。在儒家张良安排下，天明、少羽进入小圣贤庄，伪装成儒家弟子躲避秦军追捕，结识神秘少女石兰。。
