17 年前
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2029年3月某日，某国大使馆遭到一群经大规模义体改造的武装分子的入侵，众多外国使节及其同侪眷属沦为人质，事态十万火急。草薙素子（坂本真绫配音）召集巴特（松田健一郎配音）、陀古萨（新垣樽助配音）等得力属下，并制定了周密的营救计划。谁知当一切都按部就班进行之时，意外突然发生。与此同时，距离大使馆不远的一座摩天大楼内，日本首相遭到密码箱炸弹的暗杀，素子之前的上司陆军501机关的机关长库露兹（浅野麻由美饰）也在爆炸中丧生。经过缜密追查，素子等人发现一种能够篡改记忆的病毒正在网络蔓延，而她的身世居然和一连串的事件有着密切联系。危机当前，阴谋悄然复出水面…… 本片根据士郎正宗的同名原作改编，系《攻壳机动队》诞生25周年纪念作品。。该片以热带雨林为故事背景，讲述了马诺、丁凯和兰欣儿乘直升机回家，途中突遇火山喷发，整个大地陷入一片火海烟烬之中，埋藏于地下千年的化石中的变异灵兽也由此纷纷活了过来。此时直升机突遇故障，慌乱之中马诺率先跳伞降落，随后飞机也迫降在了丛林中，于是大家商议之下决定在丛林中寻找失散的马诺。马诺刚落到丛林，便被这里的部落村民发现并绑走了，而跟着降落的丁凯、兰欣儿和飞行员叔叔也都在丛林中走散了……在一路上，他们结识了新的伙伴，也遇到了越来越多从火山喷发中复活的强大的变异灵兽，还有丛林里的黑暗势力不断向他们制造各种麻烦。在大家经历了危机、彷徨、分离、挣扎、走散、重聚等一系列事件后最终成功走出困境，这片丛林得到拯救并重获生机。。
