24 年前
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23岁的设计师小米，由于幼年的一次意外，在心灵上受到了严重的打击，而生理也产生了紊乱，不仅生理期比同龄女孩晚了三年，而且严重的不规律，这使得小米的工作不在状态，爱情也是一片空白。在室友沙丽的苦劝之下，小米听取心理医生的开导，决定在2011年“找个男人狠狠爱”。 无意之中，小米在常去的一家餐厅经常碰到有一个同样只点“蛋包饭”的外科医生宇哲。而从餐厅老板的话语之中得知，宇哲在这家餐厅整整吃了三年的“蛋包饭”，只为等待一个女人的归来。正在小米十分期待那位能让男人吃三年蛋包饭的女人是什么模样时，宇哲的女友东慧突然一天出现在这家餐厅。东慧正是宇哲深爱的女人，但是刚刚的见面，却听到的是东慧已经在国外订婚，这次回来只是道声珍重。在看着心爱的女人跟着一位法国人扬长而去，宇哲的深心受到深深的挫伤。而此时的小米极度同情宇哲，不仅仅是俩人都爱吃“蛋包饭”，更重要的宇哲对爱...。二十世纪最后的夏天。那一天，人类终于知道自己并非地球这颗行星唯一的统治者。
巨型生物「怪兽」，以及驱逐怪兽的终极存在「哥斯拉」出现了。经历与怪兽之间长达半个世纪的战争，人类屡战屡败，最终计划逃出地球。2048年，经过中央政府管理的人工智能筛选，一部分人类乘坐跨恒星移民飞船「阿拉特拉姆」号踏上了前往11.9光年之外的「鲸鱼座τ星e」的旅程。然而，人类花费20年所抵达的星球与地球之间的环境差距远超预期，不适宜人类生存。
移民飞船上有一名青年——晴雄。4岁的时候，他亲眼目睹父母被哥斯拉杀害。20年来他始终想着回到地球消灭哥斯拉。移民的可能性已经灰飞烟灭，飞船内的生存环境也越发恶劣，以晴雄为中心的「重返地球派」成为主流，他们决定经过危险的长距离亚空间航行返回地球。
然而，地球经过2万年的演化已经形成了以哥斯拉为顶端的生态体系，完全成为了一个未知世界。
最终人类能否夺回地球？晴雄的命运又将如何？。
