17 年前
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在九州某地，发生了一起伤亡惨重的公共汽车挟持事件，除了司机泽井（役所广司 饰）与一对兄妹直树（宫崎将 饰）和梢（宫崎葵 饰）外，其余的乘客全部被凶徒残忍的射杀了。事后，泽井为了忘却往事而远走他乡，但充满了鲜血了回忆却如影随形。
一转眼两年过去了，为了了却心结，泽井回到了 故乡，找到了同为幸存者的直树和梢，兄妹两人有着和泽井一样的境遇，心灵受到巨大打击的他们性格阴沉离群索居。就这样，泽井住进了兄妹两的家里，和他们的远房亲戚秋彦（齐藤阳一郎 饰）一起组成了奇怪的家庭，平静的日子没过多久，一连串诡异的连环杀人案件让泽井成为了警察怀疑的对象。。近未来，当年繁华喧嚣的东京因核电站事件变成了死城，被成为世界第一大幽灵城市。然而即便在这座死寂的废墟中，仍有幸村者盘桓于此。20XX年，三名没有配备任何防辐射装备的少女出现在旧东京。她们名叫成濑荆（户松遥 配音）、深作葵（花泽香菜 配音）、野村妙子（明坂聪美 配音），是通过遗传基因改造生下来天生具有抗辐射能力的少女，统称“COPPELION”。在防卫大学附属特别工科学校教官三岛鬼兵陆佐（小山力也 配音）的指挥下，少女们四处搜索幸存者，前所未有的经历以及感受接踵而至，少女们的心中作何感想……
本片根据井上智德的漫画原作改编，COPPELION少女们的姓氏均来自日本著名导演，普通人姓氏则来自日本的文豪作家。。
