16 年前
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故事发生在日本的江户时代，一名神秘的男子出现在了武士桂小太郎（石田彰 配音）的面前，他手握妖刀“红樱”，要求试刀，这个夜晚之后，桂便下落不明。桂的宠物伊丽莎白（高松信司 配音）找到万事屋的神乐（钉宫理惠 配音）和新八（坂口大助 配音），委托他们寻找主人的下落。同时，银时（杉田智和）也受到委托，寻找四处作恶的红樱的下落。三人的线索汇聚到了一艘空中飞艇上，由于远离警察的管辖范围，飞艇里的恶势力一手遮天。在那里，银时遇见了曾经的战友现在的对手高杉晋助（子安武人 配音），高杉正带领着自己的鬼兵队企图毁灭江户。一面是穷凶极恶的恐怖分子，一边是暴虐嗜血的妖刀红樱，身受重伤的银时能够平安脱险拯救江户吗？
此次剧场版重制了《银魂》动画中的《红樱篇》，其中，在原作中未出场的真选组也将在故事中大显身手。。1、检索女
加奈子（井上真央饰）平时喜欢随时用手机检索情报，联谊派对上，她认识了名为三宅亮的男子，加奈子在手机上却查到两个“三宅亮”，一个是贵公子，另一个却是杀人犯，眼前的这个到底是？
2、自杀者再回收法
一男子（生田斗真饰）跳楼自杀，却在半空中被撒网救下，醒来后，他发现自己和一帮人被关在一个密闭的空间，并被宣布将被更有效地为国家利用生命，包括器官移植、做新药临床试验、执行特种任务等。
3、理想的火锅
和树（伊藤淳史饰）上门求婚，晚餐是他的最爱：日式火锅，可是女友一家的火锅做法和吃法都和他理想中的日式火锅相差了十万八千里。
4、诅咒杀人
一名家庭主妇（釈由美子饰）以陪审员身份参与一起法庭审判，嫌疑犯被控以诅咒连杀8人的罪名，一开始6名陪审员都感到荒诞不经，但诅咒似乎真的发生了……
5、梦的检阅官
每个人的梦境都由一支团队检阅和传送至梦中，一名女子丧失了爱子，检阅官（石坂浩二饰）不得不小心翼翼地处理她梦境的内容。。
