11 年前
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马吕斯（豪斯特·巴奇霍兹 Horst Buchholz 饰）是一个十九岁的年轻人，这个年纪的人往往会对未来充满了期望和希冀，但是马吕斯和他们不同，马吕斯的父亲经营着一家咖啡馆，而马吕斯之后的人生，几乎都被他的父亲给规划好了。 马吕斯渴望大海，希望能够做一名自由自在航行的水手，经历了种种的波折和挫折后，马吕斯总算即将实现他的梦想了。可是，在出海的前一天，一个名叫芳妮（莱斯利·卡伦 Leslie Caron 饰）的女孩向马吕斯吐露了爱意，马吕斯也同样非常的喜欢芳妮，在这个女孩和自己的梦想之剑，他必须要做出选择。而芳妮同样也面临选择，她是否该放弃自己的爱情，成全所爱的男孩呢？。因为偷税事件，曾经处于精英组的百合根友久（冈田将生 饰）被踢到早先成立的科学搜查班（ST）担任指挥官，通过之前的合作，虽然百合根始终未能完全接受青山翔（志田未来 饰）、结城翠（芦名星 饰）、黑崎勇治（漥田正孝 饰）、山吹才藏（三宅弘城 饰）以及ST实际领导者赤城左门（藤原龙也 饰）这群怪人的行径，却也为他们自身那极度专业和见斥于周遭的气息所感染。百合根一面盼望早日回到搜查一课，一面又打算多守护ST的各位一段时间。随着作为后盾的三枝警官（渡部笃郎 饰）的离开和ST新任监查松户紫织（濑户朝香 饰）的到来，ST面临生死存亡的危机。赤门渐渐走出家门，百合根则成为遏止这头怪物不可或缺的重要存在……
本片根据今野敏的原作改编。。
