23 年前
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叶家灭门案还未正式结案，沈琦遗骸竟又引发灵异之事。幸好沈琦表妹——留学多年的物理学家沈玉及时回国，利用量子物理中针对“暗物质”的研究成果，发现原来巫女曲南燕并未死去，还附身到叶家老太太身上。 曲南燕的诡计被识破后，杀害叶老太太并盗走《山海经异术录》重塑身体。复原后的曲南燕更加疯狂，从操纵尸偶袭击众人，到控制叶家镇的镇民成为自己修炼九尾狐的工具。 阿离、包天耀、春翰三人在沈玉的帮助下开始拯救镇民，谁知曲南燕竟控制了阿离最亲的儿时伙伴阿忠，杀害了春翰探长，阿离无奈用狐火烧死阿忠。面对亲人、挚友的死亡，阿离、包天耀、沈玉三人痛苦万分。 此时，叶家镇陷入了空前的危机。沈玉利用阿离血液中的能量发明了暗物质能量枪，阿离和包天耀继续阻止曲南燕将镇上人们变成尸偶，最终阿离以妖丹之力注入暗物质能量枪中战胜曲南燕。。5年前，也就是发生警视厅副总监绑架事件的5年前，湾岸还是一片普通的地方。如今，这里已经建设了每年4000万游客的观光线路。随着观光客的增加，湾岸发生的案件更加复杂与多样。是次的连续猎奇杀人事件，便是令警视厅上下都坐立不安的案件。毫无线索的凶手，凶残的杀人手法。青岛俊作（织田裕二饰）带领女同事小堇（深津绘里饰）、从美国留学回来的谈判专家真下正义（中山裕介饰）一起，向犯罪分子宣战，一定要保卫湾岸的和平！
《跳跃的大搜查线》系列电视剧时隔5年再次登上银幕，系列电影第2部。。
