18 年前
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初中毕业后，因家境不许，15岁的农村少年阿远（王晶文）放弃学业来台北做事，初尝人生的辛苦，却仍为自己的理想努力着。一年后，阿远青梅竹马的恋人阿云（辛树芬）也来到台北，了解到现实的台北同阿远信里所描述的，是两个世界。可是困顿的环境并没减少他们的快乐，因为他们拥有彼此。
阿远服兵役时，因为有每日抵达的书信，孤身在台北的阿云起初并没感到有多孤独。然而日子久了，遥远恋人的纸上诉情总比不过现实生活中鲜活男孩的低声耳语，加上对未来怀有的恐慌，阿云在阿远退伍前选择了嫁作他人妇。伤心虽有，阿远也只能选择抑压。。在一个遭受致命传染病威胁的时代，一个充满奇幻色彩的小岛上发生了一段为爱执着和牺牲的故事。著名的生物学家严国专注于研究，希望找到治愈这种疾病的方法。但是他自己却被病魔所侵，生命垂危。他的未婚妻宝宝同神秘的生灵定下契约，她自己化身为一只蝴蝶，以换来严国的康复。严国神奇的恢复了健康，却发现爱人消失，他变得忧郁孤僻。而已经变成蝴蝶的宝宝只能够看着他一天天消沉，却无能为力。不久，严国得到了邻居白兰和从大都市来到小岛的女记者杨霖的关心。在严国和杨霖之间更萌发了新的爱意，这让宝宝心里充满了苦涩。
在宝宝可以从蝴蝶变回人类的期限前的最后一年，小岛也爆发了疫情，情况非常严重。危急时刻，宝宝发现自己能够找到严国研究的解药的关键配方。于是这只脆弱的蝴蝶开始了危险的旅途，即使她的翅膀变得残破，也坚持飞翔不停歇。
伤痕累累的宝宝能够带给严国需要的药材配方飞回到他的身边吗？严国心中唯一的真爱究竟是谁？当化蝶三年的牺牲结束之时，宝宝会变回人形去找出答案吗?。
